Так и не понял HDD во внешнем боксе или внутри системника SATA?
Если во внешнем боксе то раньше как копировал внутри диска? Так же медленно? Я сейчас на своём попробовал. У меня USB 2.0 Копирование внутри диска около 20 мегабайт\сек. Но внутри диска это не совсем так. Сначала копируется в ОЗУ системника а потом по этому же кабелю обратно на диск. При USB 3.0 будет быстрее. А с одного диска на другой ещё быстрее. Кабели USB у меня новенькие, недлинные и качественные. От них тоже много зависит!