Гурген,
FLACdrop
Достаточно перетянуть мышкой файлы FLAC на окошко программы, в этой же исходной папке вы получите файлы в формате wav . Дальше я думаю проблем не должно быть.
Никаких настроек в программе для этой операции делать не нужно.
Либо можно программой
Easy CD-DA Extractor сразу же записать AudioCD диск, при этом ничего предварительно не конвертируя.