mp3kiler,
тебе надо сделать всего три вещи:
1) Сделать cue-файл.
2) По cue-файлу разрезать (или сконвертировать) flac image во flac tracks.
3) Выбрать интересующий трек и сохранить отдельно.

Навряд ли найдется программа, которая может читать твои мысли и вытягивать нужный тебе трек (какой???) из имиджа одним нажатием.
:confused:

Как писал выше Дмитрий , то самый простой вариант - это редактор. iZotope, Adobe Audition или подобный. Если человеку надо пару треков всего из целого флак-файла, то и куй не обязательно физически прописывать - скопировал нужный фрагмент, сохранил, и делов-то.
Ну или в клуб прямая дорога - там Вам и куй напишут, и порежут... И вылечат... :icon_crazy2: